Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NKX2-5P52952 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NKX2-5P52952 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKX2-5P52952 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NKX2-5P52952 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NKX2-5P52952 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms