Protein–RNA interactions for Protein: P52951

GBX2, Homeobox protein GBX-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX2P52951 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX2P52951 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX2P52951 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX2P52951 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX2P52951 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GBX2P52951 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX2P52951 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GBX2P52951 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX2P52951 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GBX2P52951 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GBX2P52951 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBX2P52951 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GBX2P52951 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX2P52951 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX2P52951 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX2P52951 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GBX2P52951 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX2P52951 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX2P52951 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX2P52951 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX2P52951 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX2P52951 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX2P52951 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX2P52951 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GBX2P52951 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX2P52951 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX2P52951 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GBX2P52951 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX2P52951 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX2P52951 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX2P52951 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX2P52951 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX2P52951 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX2P52951 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX2P52951 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GBX2P52951 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBX2P52951 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GBX2P52951 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GBX2P52951 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX2P52951 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX2P52951 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GBX2P52951 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX2P52951 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX2P52951 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX2P52951 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GBX2P52951 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX2P52951 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX2P52951 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX2P52951 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GBX2P52951 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX2P52951 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX2P52951 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GBX2P52951 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX2P52951 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX2P52951 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX2P52951 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX2P52951 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX2P52951 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX2P52951 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GBX2P52951 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX2P52951 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX2P52951 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GBX2P52951 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GBX2P52951 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX2P52951 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX2P52951 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX2P52951 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GBX2P52951 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX2P52951 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX2P52951 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX2P52951 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GBX2P52951 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX2P52951 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX2P52951 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX2P52951 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX2P52951 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX2P52951 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GBX2P52951 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX2P52951 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX2P52951 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX2P52951 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX2P52951 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX2P52951 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GBX2P52951 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX2P52951 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX2P52951 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GBX2P52951 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX2P52951 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX2P52951 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX2P52951 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GBX2P52951 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GBX2P52951 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX2P52951 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX2P52951 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX2P52951 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GBX2P52951 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX2P52951 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX2P52951 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX2P52951 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GBX2P52951 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.1 ms