Protein–RNA interactions for Protein: P52803

EFNA5, Ephrin-A5, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA5P52803 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EFNA5P52803 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EFNA5P52803 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EFNA5P52803 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EFNA5P52803 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
EFNA5P52803 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms