Protein–RNA interactions for Protein: P52432

Polr1c, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1cP52432 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1cP52432 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Polr1cP52432 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Polr1cP52432 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Polr1cP52432 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Polr1cP52432 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116 ms