Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR4P51571 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR4P51571 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR4P51571 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR4P51571 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR4P51571 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR4P51571 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSR4P51571 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR4P51571 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR4P51571 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR4P51571 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR4P51571 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR4P51571 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR4P51571 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SSR4P51571 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR4P51571 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR4P51571 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SSR4P51571 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR4P51571 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR4P51571 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SSR4P51571 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR4P51571 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR4P51571 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR4P51571 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR4P51571 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SSR4P51571 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR4P51571 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR4P51571 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR4P51571 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SSR4P51571 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR4P51571 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR4P51571 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SSR4P51571 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR4P51571 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR4P51571 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR4P51571 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR4P51571 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR4P51571 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR4P51571 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SSR4P51571 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR4P51571 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR4P51571 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR4P51571 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR4P51571 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SSR4P51571 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR4P51571 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR4P51571 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SSR4P51571 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR4P51571 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR4P51571 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR4P51571 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR4P51571 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR4P51571 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SSR4P51571 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR4P51571 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SSR4P51571 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR4P51571 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR4P51571 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR4P51571 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR4P51571 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SSR4P51571 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR4P51571 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR4P51571 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SSR4P51571 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR4P51571 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR4P51571 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR4P51571 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR4P51571 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR4P51571 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR4P51571 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR4P51571 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SSR4P51571 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR4P51571 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SSR4P51571 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR4P51571 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR4P51571 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR4P51571 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR4P51571 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR4P51571 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR4P51571 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SSR4P51571 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR4P51571 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR4P51571 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR4P51571 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SSR4P51571 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR4P51571 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SSR4P51571 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR4P51571 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR4P51571 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR4P51571 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR4P51571 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR4P51571 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SSR4P51571 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR4P51571 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR4P51571 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR4P51571 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR4P51571 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR4P51571 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR4P51571 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SSR4P51571 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms