Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORCP51449 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RORCP51449 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORCP51449 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORCP51449 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORCP51449 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORCP51449 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RORCP51449 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RORCP51449 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORCP51449 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORCP51449 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORCP51449 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RORCP51449 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORCP51449 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RORCP51449 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORCP51449 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORCP51449 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RORCP51449 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RORCP51449 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RORCP51449 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORCP51449 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORCP51449 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RORCP51449 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORCP51449 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORCP51449 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORCP51449 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RORCP51449 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORCP51449 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORCP51449 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RORCP51449 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORCP51449 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORCP51449 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORCP51449 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORCP51449 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RORCP51449 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORCP51449 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORCP51449 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORCP51449 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORCP51449 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RORCP51449 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RORCP51449 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORCP51449 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORCP51449 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORCP51449 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORCP51449 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORCP51449 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORCP51449 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORCP51449 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORCP51449 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORCP51449 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORCP51449 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORCP51449 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORCP51449 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORCP51449 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORCP51449 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORCP51449 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORCP51449 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORCP51449 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORCP51449 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RORCP51449 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORCP51449 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORCP51449 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORCP51449 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORCP51449 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORCP51449 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORCP51449 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORCP51449 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RORCP51449 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORCP51449 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORCP51449 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORCP51449 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORCP51449 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORCP51449 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORCP51449 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORCP51449 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORCP51449 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORCP51449 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORCP51449 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORCP51449 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORCP51449 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORCP51449 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORCP51449 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORCP51449 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORCP51449 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORCP51449 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORCP51449 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORCP51449 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORCP51449 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORCP51449 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORCP51449 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORCP51449 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORCP51449 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORCP51449 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORCP51449 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORCP51449 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORCP51449 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORCP51449 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORCP51449 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORCP51449 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORCP51449 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms