Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB28P51157 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAB28P51157 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB28P51157 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB28P51157 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB28P51157 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB28P51157 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAB28P51157 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB28P51157 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB28P51157 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB28P51157 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAB28P51157 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB28P51157 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB28P51157 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB28P51157 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB28P51157 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB28P51157 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB28P51157 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB28P51157 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB28P51157 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RAB28P51157 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB28P51157 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB28P51157 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB28P51157 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB28P51157 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB28P51157 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB28P51157 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB28P51157 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB28P51157 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAB28P51157 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB28P51157 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB28P51157 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB28P51157 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB28P51157 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB28P51157 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAB28P51157 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB28P51157 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB28P51157 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB28P51157 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB28P51157 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB28P51157 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAB28P51157 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB28P51157 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB28P51157 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB28P51157 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB28P51157 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAB28P51157 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB28P51157 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB28P51157 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB28P51157 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB28P51157 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB28P51157 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB28P51157 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB28P51157 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB28P51157 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB28P51157 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB28P51157 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB28P51157 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB28P51157 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB28P51157 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB28P51157 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB28P51157 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB28P51157 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB28P51157 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB28P51157 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAB28P51157 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB28P51157 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB28P51157 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB28P51157 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB28P51157 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB28P51157 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB28P51157 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB28P51157 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB28P51157 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB28P51157 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAB28P51157 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB28P51157 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB28P51157 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB28P51157 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB28P51157 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAB28P51157 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB28P51157 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB28P51157 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB28P51157 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB28P51157 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB28P51157 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAB28P51157 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB28P51157 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB28P51157 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB28P51157 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB28P51157 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB28P51157 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB28P51157 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB28P51157 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB28P51157 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB28P51157 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB28P51157 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB28P51157 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB28P51157 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAB28P51157 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms