Protein–RNA interactions for Protein: P50542

PEX5, Peroxisomal targeting signal 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX5P50542 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX5P50542 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX5P50542 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX5P50542 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX5P50542 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX5P50542 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX5P50542 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX5P50542 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX5P50542 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX5P50542 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PEX5P50542 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX5P50542 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX5P50542 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX5P50542 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX5P50542 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX5P50542 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX5P50542 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX5P50542 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX5P50542 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX5P50542 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX5P50542 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX5P50542 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
PEX5P50542 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX5P50542 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX5P50542 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX5P50542 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX5P50542 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX5P50542 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX5P50542 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX5P50542 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX5P50542 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX5P50542 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PEX5P50542 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX5P50542 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX5P50542 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX5P50542 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX5P50542 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX5P50542 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX5P50542 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX5P50542 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX5P50542 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PEX5P50542 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PEX5P50542 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PEX5P50542 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX5P50542 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX5P50542 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX5P50542 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX5P50542 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX5P50542 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX5P50542 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX5P50542 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX5P50542 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX5P50542 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX5P50542 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PEX5P50542 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX5P50542 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX5P50542 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX5P50542 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX5P50542 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX5P50542 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX5P50542 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX5P50542 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PEX5P50542 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX5P50542 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX5P50542 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX5P50542 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PEX5P50542 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PEX5P50542 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PEX5P50542 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
PEX5P50542 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PEX5P50542 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PEX5P50542 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX5P50542 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX5P50542 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX5P50542 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX5P50542 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX5P50542 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PEX5P50542 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX5P50542 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX5P50542 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX5P50542 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX5P50542 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX5P50542 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX5P50542 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX5P50542 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX5P50542 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX5P50542 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PEX5P50542 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PEX5P50542 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PEX5P50542 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PEX5P50542 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PEX5P50542 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX5P50542 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX5P50542 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX5P50542 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX5P50542 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX5P50542 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX5P50542 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX5P50542 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX5P50542 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms