Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MRE11P49959 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MRE11P49959 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MRE11P49959 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MRE11P49959 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
MRE11P49959 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MRE11P49959 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MRE11P49959 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MRE11P49959 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MRE11P49959 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
MRE11P49959 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
MRE11P49959 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MRE11P49959 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MRE11P49959 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MRE11P49959 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MRE11P49959 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MRE11P49959 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MRE11P49959 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MRE11P49959 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MRE11P49959 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MRE11P49959 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MRE11P49959 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
MRE11P49959 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MRE11P49959 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MRE11P49959 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MRE11P49959 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MRE11P49959 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MRE11P49959 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
MRE11P49959 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MRE11P49959 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MRE11P49959 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MRE11P49959 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MRE11P49959 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MRE11P49959 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MRE11P49959 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MRE11P49959 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MRE11P49959 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MRE11P49959 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MRE11P49959 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MRE11P49959 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MRE11P49959 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MRE11P49959 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MRE11P49959 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MRE11P49959 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MRE11P49959 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MRE11P49959 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MRE11P49959 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MRE11P49959 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MRE11P49959 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MRE11P49959 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MRE11P49959 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
MRE11P49959 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MRE11P49959 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MRE11P49959 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MRE11P49959 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MRE11P49959 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MRE11P49959 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MRE11P49959 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MRE11P49959 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MRE11P49959 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MRE11P49959 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MRE11P49959 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MRE11P49959 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MRE11P49959 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MRE11P49959 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MRE11P49959 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MRE11P49959 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MRE11P49959 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MRE11P49959 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MRE11P49959 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MRE11P49959 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MRE11P49959 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MRE11P49959 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MRE11P49959 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRE11P49959 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRE11P49959 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MRE11P49959 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MRE11P49959 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MRE11P49959 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MRE11P49959 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MRE11P49959 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MRE11P49959 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRE11P49959 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRE11P49959 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRE11P49959 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MRE11P49959 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MRE11P49959 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MRE11P49959 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MRE11P49959 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MRE11P49959 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRE11P49959 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRE11P49959 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRE11P49959 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRE11P49959 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MRE11P49959 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRE11P49959 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRE11P49959 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRE11P49959 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MRE11P49959 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
MRE11P49959 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.7 ms