Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3AP49840 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3AP49840 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GSK3AP49840 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GSK3AP49840 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms