Protein–RNA interactions for Protein: P49769

Psen1, Presenilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psen1P49769 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psen1P49769 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psen1P49769 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psen1P49769 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psen1P49769 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psen1P49769 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psen1P49769 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psen1P49769 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psen1P49769 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Psen1P49769 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psen1P49769 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psen1P49769 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Psen1P49769 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psen1P49769 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Psen1P49769 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms