Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HOXA1P49639 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HOXA1P49639 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA1P49639 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms