Protein–RNA interactions for Protein: P49418

AMPH, Amphiphysin, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPHP49418 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
AMPHP49418 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
AMPHP49418 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
AMPHP49418 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
AMPHP49418 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
AMPHP49418 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
AMPHP49418 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
AMPHP49418 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
AMPHP49418 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
AMPHP49418 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
AMPHP49418 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
AMPHP49418 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
AMPHP49418 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
AMPHP49418 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
AMPHP49418 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
AMPHP49418 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
AMPHP49418 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
AMPHP49418 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
AMPHP49418 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
AMPHP49418 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
AMPHP49418 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
AMPHP49418 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
AMPHP49418 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
AMPHP49418 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
AMPHP49418 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
AMPHP49418 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
AMPHP49418 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
AMPHP49418 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
AMPHP49418 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
AMPHP49418 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
AMPHP49418 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
AMPHP49418 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
AMPHP49418 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
AMPHP49418 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
AMPHP49418 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
AMPHP49418 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
AMPHP49418 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
AMPHP49418 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
AMPHP49418 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
AMPHP49418 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
AMPHP49418 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
AMPHP49418 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
AMPHP49418 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
AMPHP49418 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
AMPHP49418 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
AMPHP49418 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
AMPHP49418 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
AMPHP49418 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
AMPHP49418 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
AMPHP49418 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
AMPHP49418 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
AMPHP49418 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
AMPHP49418 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
AMPHP49418 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
AMPHP49418 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
AMPHP49418 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
AMPHP49418 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
AMPHP49418 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
AMPHP49418 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
AMPHP49418 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
AMPHP49418 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
AMPHP49418 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
AMPHP49418 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
AMPHP49418 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
AMPHP49418 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
AMPHP49418 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
AMPHP49418 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
AMPHP49418 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
AMPHP49418 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
AMPHP49418 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
AMPHP49418 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
AMPHP49418 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
AMPHP49418 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
AMPHP49418 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
AMPHP49418 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
AMPHP49418 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
AMPHP49418 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
AMPHP49418 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
AMPHP49418 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
AMPHP49418 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
AMPHP49418 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
AMPHP49418 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
AMPHP49418 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
AMPHP49418 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
AMPHP49418 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
AMPHP49418 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
AMPHP49418 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
AMPHP49418 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
AMPHP49418 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
AMPHP49418 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
AMPHP49418 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
AMPHP49418 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
AMPHP49418 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
AMPHP49418 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
AMPHP49418 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
AMPHP49418 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
AMPHP49418 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
AMPHP49418 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
AMPHP49418 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
AMPHP49418 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms