Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ercc3P49135 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc3P49135 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ercc3P49135 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc3P49135 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc3P49135 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ercc3P49135 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ercc3P49135 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc3P49135 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ercc3P49135 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ercc3P49135 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Ercc3P49135 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc3P49135 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc3P49135 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ercc3P49135 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc3P49135 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ercc3P49135 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ercc3P49135 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Ercc3P49135 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ercc3P49135 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ercc3P49135 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ercc3P49135 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ercc3P49135 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms