Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Brca1P48754 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brca1P48754 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Brca1P48754 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Brca1P48754 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Brca1P48754 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Brca1P48754 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Brca1P48754 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Brca1P48754 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Brca1P48754 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Brca1P48754 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Brca1P48754 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Brca1P48754 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Brca1P48754 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brca1P48754 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Brca1P48754 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Brca1P48754 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Brca1P48754 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms