Protein–RNA interactions for Protein: P48643

CCT5, T-complex protein 1 subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT5P48643 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT5P48643 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT5P48643 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT5P48643 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCT5P48643 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT5P48643 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT5P48643 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT5P48643 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCT5P48643 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCT5P48643 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT5P48643 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT5P48643 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT5P48643 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT5P48643 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCT5P48643 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT5P48643 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCT5P48643 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT5P48643 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT5P48643 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT5P48643 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT5P48643 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT5P48643 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT5P48643 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT5P48643 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT5P48643 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CCT5P48643 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT5P48643 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT5P48643 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT5P48643 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CCT5P48643 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT5P48643 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CCT5P48643 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT5P48643 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT5P48643 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT5P48643 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT5P48643 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CCT5P48643 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT5P48643 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT5P48643 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT5P48643 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT5P48643 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CCT5P48643 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT5P48643 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT5P48643 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT5P48643 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCT5P48643 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT5P48643 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCT5P48643 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT5P48643 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT5P48643 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT5P48643 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT5P48643 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT5P48643 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT5P48643 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT5P48643 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT5P48643 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCT5P48643 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT5P48643 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT5P48643 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCT5P48643 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT5P48643 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT5P48643 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT5P48643 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT5P48643 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT5P48643 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT5P48643 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCT5P48643 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT5P48643 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT5P48643 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT5P48643 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT5P48643 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT5P48643 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCT5P48643 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT5P48643 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT5P48643 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT5P48643 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCT5P48643 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT5P48643 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT5P48643 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT5P48643 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCT5P48643 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT5P48643 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT5P48643 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT5P48643 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT5P48643 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCT5P48643 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCT5P48643 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCT5P48643 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCT5P48643 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT5P48643 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT5P48643 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT5P48643 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCT5P48643 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT5P48643 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT5P48643 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT5P48643 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT5P48643 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT5P48643 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT5P48643 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCT5P48643 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms