Protein–RNA interactions for Protein: P48316

Gadd45a, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45aP48316 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gadd45aP48316 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gadd45aP48316 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gadd45aP48316 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gadd45aP48316 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms