Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax7P47239 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pax7P47239 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax7P47239 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax7P47239 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pax7P47239 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax7P47239 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax7P47239 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax7P47239 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pax7P47239 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Pax7P47239 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pax7P47239 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pax7P47239 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pax7P47239 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pax7P47239 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pax7P47239 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax7P47239 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pax7P47239 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pax7P47239 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pax7P47239 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pax7P47239 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms