Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nedd4P46935 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nedd4P46935 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Nedd4P46935 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nedd4P46935 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nedd4P46935 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nedd4P46935 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nedd4P46935 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms