Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zic1P46684 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zic1P46684 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zic1P46684 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zic1P46684 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Zic1P46684 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zic1P46684 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zic1P46684 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Zic1P46684 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Zic1P46684 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Zic1P46684 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zic1P46684 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Zic1P46684 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zic1P46684 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zic1P46684 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms