Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
InaP46660 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
InaP46660 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
InaP46660 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
InaP46660 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
InaP46660 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
InaP46660 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
InaP46660 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
InaP46660 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
InaP46660 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
InaP46660 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
InaP46660 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
InaP46660 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
InaP46660 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
InaP46660 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
InaP46660 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
InaP46660 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
InaP46660 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
InaP46660 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
InaP46660 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
InaP46660 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
InaP46660 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
InaP46660 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
InaP46660 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
InaP46660 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
InaP46660 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
InaP46660 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InaP46660 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InaP46660 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InaP46660 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InaP46660 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InaP46660 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InaP46660 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
InaP46660 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
InaP46660 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
InaP46660 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
InaP46660 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
InaP46660 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
InaP46660 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
InaP46660 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
InaP46660 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
InaP46660 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
InaP46660 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
InaP46660 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
InaP46660 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
InaP46660 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
InaP46660 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
InaP46660 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
InaP46660 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
InaP46660 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
InaP46660 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
InaP46660 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
InaP46660 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
InaP46660 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
InaP46660 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
InaP46660 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
InaP46660 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
InaP46660 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
InaP46660 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
InaP46660 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
InaP46660 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
InaP46660 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
InaP46660 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
InaP46660 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
InaP46660 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
InaP46660 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
InaP46660 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
InaP46660 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
InaP46660 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
InaP46660 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
InaP46660 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
InaP46660 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
InaP46660 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
InaP46660 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
InaP46660 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
InaP46660 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
InaP46660 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
InaP46660 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
InaP46660 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
InaP46660 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
InaP46660 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
InaP46660 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
InaP46660 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
InaP46660 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
InaP46660 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
InaP46660 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
InaP46660 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
InaP46660 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
InaP46660 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
InaP46660 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
InaP46660 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
InaP46660 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
InaP46660 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
InaP46660 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
InaP46660 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
InaP46660 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
InaP46660 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
InaP46660 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
InaP46660 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
InaP46660 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms