Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps4bP46467 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps4bP46467 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps4bP46467 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps4bP46467 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Vps4bP46467 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms