Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSFMP43897 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSFMP43897 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSFMP43897 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSFMP43897 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TSFMP43897 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TSFMP43897 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSFMP43897 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSFMP43897 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSFMP43897 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TSFMP43897 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSFMP43897 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSFMP43897 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TSFMP43897 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TSFMP43897 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSFMP43897 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSFMP43897 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSFMP43897 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSFMP43897 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TSFMP43897 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TSFMP43897 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
TSFMP43897 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSFMP43897 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSFMP43897 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSFMP43897 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSFMP43897 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSFMP43897 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSFMP43897 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TSFMP43897 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSFMP43897 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TSFMP43897 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSFMP43897 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSFMP43897 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSFMP43897 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TSFMP43897 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSFMP43897 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSFMP43897 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSFMP43897 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TSFMP43897 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSFMP43897 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSFMP43897 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSFMP43897 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TSFMP43897 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSFMP43897 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TSFMP43897 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TSFMP43897 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSFMP43897 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TSFMP43897 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSFMP43897 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSFMP43897 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSFMP43897 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSFMP43897 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSFMP43897 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TSFMP43897 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSFMP43897 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSFMP43897 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSFMP43897 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TSFMP43897 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSFMP43897 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TSFMP43897 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSFMP43897 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TSFMP43897 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSFMP43897 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSFMP43897 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TSFMP43897 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSFMP43897 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSFMP43897 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSFMP43897 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TSFMP43897 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TSFMP43897 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSFMP43897 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
TSFMP43897 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSFMP43897 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSFMP43897 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TSFMP43897 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TSFMP43897 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSFMP43897 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TSFMP43897 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSFMP43897 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSFMP43897 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSFMP43897 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TSFMP43897 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TSFMP43897 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSFMP43897 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSFMP43897 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TSFMP43897 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TSFMP43897 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.2 ms