Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD52P43351 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD52P43351 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAD52P43351 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD52P43351 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD52P43351 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD52P43351 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD52P43351 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD52P43351 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAD52P43351 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAD52P43351 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD52P43351 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD52P43351 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD52P43351 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD52P43351 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD52P43351 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RAD52P43351 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD52P43351 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD52P43351 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD52P43351 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD52P43351 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD52P43351 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD52P43351 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD52P43351 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD52P43351 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RAD52P43351 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD52P43351 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD52P43351 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD52P43351 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD52P43351 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD52P43351 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAD52P43351 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD52P43351 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAD52P43351 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD52P43351 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD52P43351 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD52P43351 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAD52P43351 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD52P43351 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD52P43351 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD52P43351 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD52P43351 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAD52P43351 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD52P43351 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD52P43351 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD52P43351 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD52P43351 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAD52P43351 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD52P43351 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD52P43351 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD52P43351 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAD52P43351 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD52P43351 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD52P43351 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD52P43351 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD52P43351 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAD52P43351 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD52P43351 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD52P43351 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD52P43351 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RAD52P43351 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RAD52P43351 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD52P43351 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD52P43351 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAD52P43351 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD52P43351 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD52P43351 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD52P43351 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD52P43351 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RAD52P43351 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD52P43351 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD52P43351 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAD52P43351 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD52P43351 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD52P43351 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD52P43351 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD52P43351 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD52P43351 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD52P43351 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD52P43351 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAD52P43351 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD52P43351 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD52P43351 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD52P43351 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD52P43351 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD52P43351 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD52P43351 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RAD52P43351 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD52P43351 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD52P43351 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD52P43351 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAD52P43351 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD52P43351 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD52P43351 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD52P43351 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD52P43351 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAD52P43351 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD52P43351 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD52P43351 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RAD52P43351 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms