Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CTSKP43235 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSKP43235 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSKP43235 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSKP43235 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSKP43235 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSKP43235 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSKP43235 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSKP43235 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSKP43235 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSKP43235 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSKP43235 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSKP43235 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSKP43235 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSKP43235 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSKP43235 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSKP43235 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSKP43235 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSKP43235 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSKP43235 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSKP43235 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSKP43235 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSKP43235 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSKP43235 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSKP43235 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSKP43235 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSKP43235 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTSKP43235 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSKP43235 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSKP43235 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSKP43235 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSKP43235 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSKP43235 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CTSKP43235 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTSKP43235 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTSKP43235 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTSKP43235 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTSKP43235 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTSKP43235 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTSKP43235 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSKP43235 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSKP43235 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CTSKP43235 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTSKP43235 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSKP43235 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSKP43235 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSKP43235 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTSKP43235 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSKP43235 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSKP43235 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSKP43235 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSKP43235 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSKP43235 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSKP43235 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSKP43235 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTSKP43235 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTSKP43235 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTSKP43235 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSKP43235 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSKP43235 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSKP43235 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSKP43235 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTSKP43235 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSKP43235 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSKP43235 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTSKP43235 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSKP43235 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSKP43235 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSKP43235 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSKP43235 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSKP43235 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSKP43235 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSKP43235 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTSKP43235 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSKP43235 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSKP43235 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSKP43235 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CTSKP43235 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSKP43235 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSKP43235 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSKP43235 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSKP43235 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSKP43235 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CTSKP43235 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSKP43235 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CTSKP43235 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSKP43235 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSKP43235 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSKP43235 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CTSKP43235 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSKP43235 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CTSKP43235 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSKP43235 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSKP43235 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSKP43235 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSKP43235 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSKP43235 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSKP43235 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSKP43235 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CTSKP43235 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms