Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC19A1P41440 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC19A1P41440 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC19A1P41440 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC19A1P41440 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms