Protein–RNA interactions for Protein: P40313

CTRL, Chymotrypsin-like protease CTRL-1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRLP40313 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTRLP40313 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTRLP40313 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTRLP40313 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTRLP40313 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTRLP40313 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CTRLP40313 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTRLP40313 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTRLP40313 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CTRLP40313 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTRLP40313 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTRLP40313 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CTRLP40313 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTRLP40313 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTRLP40313 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTRLP40313 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTRLP40313 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTRLP40313 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CTRLP40313 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTRLP40313 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTRLP40313 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTRLP40313 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTRLP40313 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTRLP40313 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTRLP40313 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTRLP40313 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CTRLP40313 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTRLP40313 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTRLP40313 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTRLP40313 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CTRLP40313 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTRLP40313 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CTRLP40313 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CTRLP40313 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CTRLP40313 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTRLP40313 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTRLP40313 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTRLP40313 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CTRLP40313 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTRLP40313 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTRLP40313 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTRLP40313 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CTRLP40313 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTRLP40313 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTRLP40313 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTRLP40313 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTRLP40313 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTRLP40313 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTRLP40313 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CTRLP40313 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTRLP40313 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CTRLP40313 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTRLP40313 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTRLP40313 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTRLP40313 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CTRLP40313 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTRLP40313 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTRLP40313 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTRLP40313 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CTRLP40313 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTRLP40313 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTRLP40313 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CTRLP40313 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CTRLP40313 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTRLP40313 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTRLP40313 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTRLP40313 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTRLP40313 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTRLP40313 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTRLP40313 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTRLP40313 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CTRLP40313 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTRLP40313 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTRLP40313 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTRLP40313 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTRLP40313 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CTRLP40313 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTRLP40313 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTRLP40313 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTRLP40313 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTRLP40313 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CTRLP40313 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CTRLP40313 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTRLP40313 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTRLP40313 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTRLP40313 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTRLP40313 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CTRLP40313 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTRLP40313 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTRLP40313 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTRLP40313 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTRLP40313 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTRLP40313 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTRLP40313 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CTRLP40313 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTRLP40313 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTRLP40313 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTRLP40313 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTRLP40313 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CTRLP40313 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms