Protein–RNA interactions for Protein: P39447

Tjp1, Tight junction protein ZO-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tjp1P39447 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
Tjp1P39447 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tjp1P39447 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
Tjp1P39447 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tjp1P39447 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tjp1P39447 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Tjp1P39447 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tjp1P39447 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tjp1P39447 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tjp1P39447 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.7 ms