Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upk2P38575 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upk2P38575 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upk2P38575 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Upk2P38575 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk2P38575 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Upk2P38575 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upk2P38575 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upk2P38575 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Upk2P38575 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Upk2P38575 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk2P38575 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Upk2P38575 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk2P38575 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Upk2P38575 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upk2P38575 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Upk2P38575 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk2P38575 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Upk2P38575 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk2P38575 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk2P38575 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Upk2P38575 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms