Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
FLT4P35916 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FLT4P35916 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
FLT4P35916 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
FLT4P35916 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
FLT4P35916 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FLT4P35916 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FLT4P35916 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
FLT4P35916 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FLT4P35916 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
FLT4P35916 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
FLT4P35916 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FLT4P35916 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
FLT4P35916 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
FLT4P35916 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.07
FLT4P35916 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FLT4P35916 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
FLT4P35916 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FLT4P35916 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
FLT4P35916 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FLT4P35916 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FLT4P35916 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FLT4P35916 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
FLT4P35916 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
FLT4P35916 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FLT4P35916 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
FLT4P35916 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FLT4P35916 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FLT4P35916 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
FLT4P35916 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
FLT4P35916 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
FLT4P35916 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
FLT4P35916 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FLT4P35916 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
FLT4P35916 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
FLT4P35916 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
FLT4P35916 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
FLT4P35916 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
FLT4P35916 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
FLT4P35916 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
FLT4P35916 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
FLT4P35916 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
FLT4P35916 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FLT4P35916 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FLT4P35916 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
FLT4P35916 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
FLT4P35916 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FLT4P35916 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FLT4P35916 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
FLT4P35916 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FLT4P35916 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
FLT4P35916 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FLT4P35916 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FLT4P35916 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
FLT4P35916 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
FLT4P35916 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FLT4P35916 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FLT4P35916 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FLT4P35916 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
FLT4P35916 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
FLT4P35916 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
FLT4P35916 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
FLT4P35916 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
FLT4P35916 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
FLT4P35916 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FLT4P35916 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FLT4P35916 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
FLT4P35916 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
FLT4P35916 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FLT4P35916 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FLT4P35916 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
FLT4P35916 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FLT4P35916 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
FLT4P35916 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FLT4P35916 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FLT4P35916 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FLT4P35916 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
FLT4P35916 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
FLT4P35916 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FLT4P35916 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
FLT4P35916 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FLT4P35916 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FLT4P35916 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FLT4P35916 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FLT4P35916 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FLT4P35916 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FLT4P35916 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FLT4P35916 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FLT4P35916 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FLT4P35916 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FLT4P35916 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FLT4P35916 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FLT4P35916 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FLT4P35916 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FLT4P35916 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
FLT4P35916 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FLT4P35916 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FLT4P35916 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FLT4P35916 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FLT4P35916 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms