Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
PtprkP35822 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
PtprkP35822 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
PtprkP35822 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
PtprkP35822 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC38.46■■■■□ 3.75
PtprkP35822 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
PtprkP35822 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
PtprkP35822 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PtprkP35822 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PtprkP35822 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PtprkP35822 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PtprkP35822 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
PtprkP35822 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
PtprkP35822 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
PtprkP35822 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
PtprkP35822 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PtprkP35822 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
PtprkP35822 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
PtprkP35822 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC38.28■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
PtprkP35822 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
PtprkP35822 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprkP35822 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
PtprkP35822 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
PtprkP35822 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
PtprkP35822 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
PtprkP35822 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC38.16■■■■□ 3.7
PtprkP35822 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
PtprkP35822 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
PtprkP35822 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
PtprkP35822 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
PtprkP35822 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
PtprkP35822 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
PtprkP35822 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC38.13■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
PtprkP35822 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC38.11■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
PtprkP35822 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PtprkP35822 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
PtprkP35822 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC38.04■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
PtprkP35822 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms