Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ly6dP35459 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ly6dP35459 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ly6dP35459 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ly6dP35459 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Ly6dP35459 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms