Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 NIT1-206ENST00000473918 223 ntTSL 38.51□□□□□ -1.052e-13■■■■■ 54
GTF2F1P35269 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 54
GTF2F1P35269 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.069e-9■■■■■ 53.9
GTF2F1P35269 PHF10-204ENST00000480008 4285 ntTSL 1 (best)19.65■□□□□ 0.749e-9■■■■■ 53.9
GTF2F1P35269 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.499e-9■■■■■ 53.9
GTF2F1P35269 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.146e-15■■■■■ 53.8
GTF2F1P35269 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.885e-7■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 216.94■□□□□ 0.35e-7■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 MAPK8IP3-215ENST00000570131 354 ntTSL 330.38■■■□□ 2.453e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.183e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.033e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 PCSK9-202ENST00000490692 3891 ntTSL 213.8□□□□□ -0.23e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 TRIM25-205ENST00000572021 1555 ntTSL 1 (best)12.94□□□□□ -0.343e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 TRIM25-203ENST00000570473 498 ntTSL 310.86□□□□□ -0.673e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -13e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -13e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.083e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 POLA1-203ENST00000480125 580 ntTSL 35.03□□□□□ -1.63e-13■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 TNFSF14-201ENST00000245912 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 PI4KA-215ENST00000485963 2301 ntTSL 227.55■■■□□ 21e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 PI4KA-203ENST00000449120 574 ntTSL 419.18■□□□□ 0.661e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 SEPT6-206ENST00000460411 1393 ntTSL 223.52■■□□□ 1.369e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.129e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.549e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.429e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.39e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 SEPT6-205ENST00000394610 4694 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.229e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 SEPT6-207ENST00000467310 1061 ntTSL 310.48□□□□□ -0.739e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 SEPT6-203ENST00000354416 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.869e-8■■■■■ 53.6
GTF2F1P35269 EIF4B-210ENST00000550704 1476 ntTSL 515.76■□□□□ 0.115e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-205ENST00000549481 1097 ntTSL 514.53□□□□□ -0.085e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-202ENST00000416762 1985 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.385e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-203ENST00000420463 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.45e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-212ENST00000551527 769 ntTSL 49.92□□□□□ -0.825e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-207ENST00000549645 590 ntTSL 49.8□□□□□ -0.845e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-204ENST00000549077 885 ntTSL 59.8□□□□□ -0.845e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-209ENST00000550390 871 ntTSL 59.56□□□□□ -0.885e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-213ENST00000552490 841 ntTSL 29.36□□□□□ -0.915e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.975e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 EIF4B-211ENST00000551002 537 ntTSL 47□□□□□ -1.295e-20■■■■■ 53.5
GTF2F1P35269 TICRR-203ENST00000561095 2367 ntTSL 1 (best)18.03■□□□□ 0.486e-9■■■■■ 53.3
GTF2F1P35269 PABPN1-206ENST00000556809 969 ntTSL 224.69■■□□□ 1.543e-12■■■■■ 53.1
GTF2F1P35269 TMC6-204ENST00000585849 552 ntTSL 221.56■■□□□ 1.045e-14■■■■■ 53.1
GTF2F1P35269 AGPAT3-213ENST00000479117 1510 ntTSL 519.25■□□□□ 0.675e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 AGPAT3-210ENST00000457068 924 ntTSL 317.74■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 AGPAT3-206ENST00000422850 1003 ntTSL 517.74■□□□□ 0.435e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.365e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 AGPAT3-214ENST00000481319 616 ntTSL 316.34■□□□□ 0.215e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 AGPAT3-211ENST00000467358 3955 ntTSL 211.79□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.082e-8■■■■■ 53
GTF2F1P35269 EFHC1-204ENST00000491749 496 ntTSL 427.15■■□□□ 1.942e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.82e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 EFHC1-235ENST00000637849 2746 ntTSL 516.41■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 PAQR8-203ENST00000512121 582 ntTSL 314.08□□□□□ -0.162e-7■■■■■ 53
GTF2F1P35269 AC008105.3-205ENST00000590495 652 ntTSL 327.75■■■□□ 2.039e-15■■■■■ 52.9
GTF2F1P35269 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.519e-15■■■■■ 52.9
GTF2F1P35269 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.025e-17■■■■■ 52.9
GTF2F1P35269 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 216.73■□□□□ 0.277e-8■■■■■ 52.9
GTF2F1P35269 GPR137-218ENST00000546139 1274 ntTSL 1 (best)19.87■□□□□ 0.773e-11■■■■■ 52.8
GTF2F1P35269 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.084e-7■■■■■ 52.8
GTF2F1P35269 ADARB1-214ENST00000629643 4583 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 52.5
GTF2F1P35269 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-202ENST00000584900 1636 ntTSL 219.2■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 52.3
GTF2F1P35269 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-201ENST00000579700 1222 ntTSL 218.02■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 52.3
GTF2F1P35269 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.062e-7■■■■■ 52.3
GTF2F1P35269 DTX2P1-201ENST00000425797 1633 ntBASIC14.09□□□□□ -0.152e-7■■■■■ 52.3
GTF2F1P35269 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.283e-7■■■■■ 52.2
GTF2F1P35269 PFKFB4-209ENST00000467176 643 ntTSL 315.29■□□□□ 0.046e-9■■■■■ 52.2
GTF2F1P35269 LARP4-208ENST00000520064 2068 ntTSL 513.33□□□□□ -0.282e-8■■■■■ 52.2
GTF2F1P35269 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.358e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 MBOAT7-214ENST00000495968 465 ntTSL 529.46■■■□□ 2.318e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.058e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.028e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 C11orf80-209ENST00000527368 812 ntTSL 526.74■■□□□ 1.878e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.658e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-204ENST00000527085 595 ntTSL 525.36■■□□□ 1.658e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-206ENST00000527746 590 ntTSL 223.98■■□□□ 1.438e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 C11orf80-202ENST00000524551 548 ntAPPRIS ALT2 TSL 522.34■■□□□ 1.178e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-205ENST00000527638 561 ntTSL 422.34■■□□□ 1.178e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-210ENST00000530506 1297 ntTSL 522.34■■□□□ 1.178e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.148e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 C11orf80-217ENST00000534325 583 ntAPPRIS ALT2 TSL 321.27■■□□□ 18e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.978e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.768e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 MBOAT7-211ENST00000491216 564 ntTSL 219.21■□□□□ 0.678e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-211ENST00000530541 684 ntTSL 218.75■□□□□ 0.598e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.468e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.468e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.368e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.248e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.178e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 08e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 C11orf80-211ENST00000531400 367 ntTSL 314.19□□□□□ -0.148e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 TOLLIP-213ENST00000532551 576 ntTSL 213.71□□□□□ -0.218e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 BABAM2-202ENST00000344773 1852 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.548e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.65□□□□□ -1.038e-13■■■■■ 52
GTF2F1P35269 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.138e-13■■■■■ 52
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 212.3 ms