Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA3P35244 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA3P35244 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA3P35244 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA3P35244 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA3P35244 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA3P35244 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA3P35244 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA3P35244 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA3P35244 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA3P35244 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA3P35244 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA3P35244 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA3P35244 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA3P35244 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA3P35244 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA3P35244 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA3P35244 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA3P35244 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA3P35244 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA3P35244 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA3P35244 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA3P35244 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA3P35244 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA3P35244 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA3P35244 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA3P35244 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA3P35244 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA3P35244 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA3P35244 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA3P35244 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA3P35244 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA3P35244 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPA3P35244 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPA3P35244 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPA3P35244 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA3P35244 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA3P35244 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA3P35244 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA3P35244 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA3P35244 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA3P35244 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA3P35244 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPA3P35244 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA3P35244 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA3P35244 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA3P35244 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPA3P35244 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPA3P35244 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPA3P35244 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA3P35244 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA3P35244 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA3P35244 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPA3P35244 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPA3P35244 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPA3P35244 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPA3P35244 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RPA3P35244 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
RPA3P35244 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPA3P35244 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPA3P35244 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPA3P35244 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA3P35244 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA3P35244 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA3P35244 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA3P35244 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA3P35244 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPA3P35244 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPA3P35244 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPA3P35244 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPA3P35244 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPA3P35244 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPA3P35244 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPA3P35244 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPA3P35244 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPA3P35244 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPA3P35244 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPA3P35244 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPA3P35244 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPA3P35244 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPA3P35244 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RPA3P35244 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPA3P35244 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA3P35244 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA3P35244 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA3P35244 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA3P35244 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA3P35244 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPA3P35244 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPA3P35244 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA3P35244 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA3P35244 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA3P35244 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPA3P35244 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA3P35244 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA3P35244 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA3P35244 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA3P35244 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA3P35244 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPA3P35244 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms