Protein–RNA interactions for Protein: P35173

Stfa3, Stefin-3, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa3P35173 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Stfa3P35173 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Stfa3P35173 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Stfa3P35173 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Stfa3P35173 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Stfa3P35173 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms