Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ABCD1P33897 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ABCD1P33897 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ABCD1P33897 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ABCD1P33897 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ABCD1P33897 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 259.6 ms