Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Apoc3P33622 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Apoc3P33622 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Apoc3P33622 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Apoc3P33622 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms