Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH5P33151 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH5P33151 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH5P33151 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CDH5P33151 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH5P33151 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CDH5P33151 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH5P33151 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH5P33151 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH5P33151 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH5P33151 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH5P33151 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CDH5P33151 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH5P33151 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CDH5P33151 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CDH5P33151 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CDH5P33151 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH5P33151 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH5P33151 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH5P33151 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CDH5P33151 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH5P33151 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH5P33151 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CDH5P33151 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH5P33151 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH5P33151 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH5P33151 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH5P33151 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH5P33151 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CDH5P33151 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH5P33151 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CDH5P33151 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH5P33151 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH5P33151 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH5P33151 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH5P33151 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CDH5P33151 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH5P33151 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH5P33151 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CDH5P33151 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH5P33151 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH5P33151 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CDH5P33151 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH5P33151 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH5P33151 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH5P33151 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CDH5P33151 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH5P33151 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CDH5P33151 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH5P33151 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH5P33151 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CDH5P33151 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH5P33151 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH5P33151 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH5P33151 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH5P33151 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CDH5P33151 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CDH5P33151 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CDH5P33151 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH5P33151 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH5P33151 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH5P33151 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CDH5P33151 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH5P33151 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH5P33151 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CDH5P33151 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH5P33151 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH5P33151 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CDH5P33151 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CDH5P33151 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CDH5P33151 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH5P33151 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH5P33151 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CDH5P33151 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CDH5P33151 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CDH5P33151 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CDH5P33151 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH5P33151 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH5P33151 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH5P33151 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH5P33151 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH5P33151 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CDH5P33151 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH5P33151 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CDH5P33151 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms