Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP2P32456 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP2P32456 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GBP2P32456 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP2P32456 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP2P32456 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP2P32456 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GBP2P32456 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP2P32456 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP2P32456 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GBP2P32456 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP2P32456 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP2P32456 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP2P32456 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GBP2P32456 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GBP2P32456 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP2P32456 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP2P32456 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GBP2P32456 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GBP2P32456 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP2P32456 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP2P32456 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GBP2P32456 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP2P32456 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GBP2P32456 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP2P32456 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP2P32456 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GBP2P32456 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP2P32456 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP2P32456 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GBP2P32456 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP2P32456 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP2P32456 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP2P32456 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP2P32456 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP2P32456 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GBP2P32456 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP2P32456 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP2P32456 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP2P32456 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GBP2P32456 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP2P32456 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP2P32456 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP2P32456 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP2P32456 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GBP2P32456 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP2P32456 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP2P32456 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP2P32456 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GBP2P32456 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP2P32456 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP2P32456 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP2P32456 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP2P32456 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP2P32456 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GBP2P32456 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP2P32456 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GBP2P32456 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP2P32456 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GBP2P32456 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP2P32456 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP2P32456 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP2P32456 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP2P32456 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GBP2P32456 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP2P32456 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP2P32456 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP2P32456 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP2P32456 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GBP2P32456 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GBP2P32456 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GBP2P32456 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GBP2P32456 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP2P32456 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP2P32456 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GBP2P32456 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP2P32456 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP2P32456 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GBP2P32456 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GBP2P32456 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP2P32456 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP2P32456 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP2P32456 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GBP2P32456 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GBP2P32456 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP2P32456 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP2P32456 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GBP2P32456 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP2P32456 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP2P32456 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP2P32456 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP2P32456 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GBP2P32456 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP2P32456 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP2P32456 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP2P32456 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GBP2P32456 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP2P32456 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GBP2P32456 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GBP2P32456 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms