Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX1P32242 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OTX1P32242 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX1P32242 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX1P32242 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OTX1P32242 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX1P32242 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX1P32242 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OTX1P32242 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX1P32242 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX1P32242 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX1P32242 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX1P32242 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX1P32242 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX1P32242 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
OTX1P32242 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX1P32242 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX1P32242 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX1P32242 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX1P32242 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX1P32242 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX1P32242 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
OTX1P32242 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX1P32242 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX1P32242 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX1P32242 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX1P32242 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX1P32242 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX1P32242 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
OTX1P32242 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTX1P32242 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTX1P32242 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
OTX1P32242 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTX1P32242 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
OTX1P32242 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTX1P32242 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
OTX1P32242 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
OTX1P32242 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
OTX1P32242 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX1P32242 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX1P32242 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX1P32242 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTX1P32242 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX1P32242 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX1P32242 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTX1P32242 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTX1P32242 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX1P32242 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX1P32242 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX1P32242 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX1P32242 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX1P32242 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX1P32242 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX1P32242 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTX1P32242 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX1P32242 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTX1P32242 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTX1P32242 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTX1P32242 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTX1P32242 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTX1P32242 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX1P32242 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX1P32242 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX1P32242 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX1P32242 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX1P32242 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX1P32242 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX1P32242 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX1P32242 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTX1P32242 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX1P32242 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX1P32242 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX1P32242 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX1P32242 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX1P32242 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTX1P32242 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX1P32242 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX1P32242 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX1P32242 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX1P32242 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX1P32242 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX1P32242 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
OTX1P32242 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX1P32242 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
OTX1P32242 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX1P32242 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX1P32242 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX1P32242 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX1P32242 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX1P32242 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX1P32242 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX1P32242 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
OTX1P32242 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX1P32242 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
OTX1P32242 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX1P32242 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX1P32242 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX1P32242 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX1P32242 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
OTX1P32242 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms