Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
L1CAMP32004 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
L1CAMP32004 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
L1CAMP32004 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
L1CAMP32004 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms