Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
HOXA7P31268 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HOXA7P31268 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HOXA7P31268 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HOXA7P31268 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HOXA7P31268 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms