Protein–RNA interactions for Protein: P31040

SDHA, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] flavoprotein subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAP31040 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAP31040 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SDHAP31040 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAP31040 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAP31040 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAP31040 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SDHAP31040 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAP31040 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SDHAP31040 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAP31040 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAP31040 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAP31040 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SDHAP31040 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAP31040 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAP31040 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAP31040 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAP31040 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SDHAP31040 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAP31040 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SDHAP31040 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAP31040 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAP31040 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAP31040 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAP31040 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAP31040 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAP31040 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SDHAP31040 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAP31040 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAP31040 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAP31040 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SDHAP31040 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAP31040 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAP31040 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAP31040 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAP31040 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAP31040 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAP31040 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SDHAP31040 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SDHAP31040 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAP31040 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAP31040 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAP31040 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAP31040 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAP31040 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAP31040 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SDHAP31040 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SDHAP31040 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAP31040 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SDHAP31040 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAP31040 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAP31040 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAP31040 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAP31040 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAP31040 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SDHAP31040 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAP31040 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAP31040 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAP31040 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAP31040 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAP31040 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAP31040 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAP31040 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SDHAP31040 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDHAP31040 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAP31040 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAP31040 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDHAP31040 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDHAP31040 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDHAP31040 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDHAP31040 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAP31040 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAP31040 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAP31040 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDHAP31040 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAP31040 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAP31040 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAP31040 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAP31040 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAP31040 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDHAP31040 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAP31040 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAP31040 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAP31040 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAP31040 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDHAP31040 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAP31040 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAP31040 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAP31040 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAP31040 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAP31040 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SDHAP31040 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms