Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Kif5cP28738 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Kif5cP28738 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Kif5cP28738 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Kif5cP28738 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Kif5cP28738 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms