Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa2P28309 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Defa2P28309 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa2P28309 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa2P28309 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Defa2P28309 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa2P28309 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa2P28309 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa2P28309 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Defa2P28309 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa2P28309 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Defa2P28309 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.7 ms