Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Aco1P28271 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Aco1P28271 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Aco1P28271 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Aco1P28271 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Aco1P28271 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Aco1P28271 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Aco1P28271 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Aco1P28271 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Aco1P28271 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Aco1P28271 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Aco1P28271 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aco1P28271 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aco1P28271 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aco1P28271 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aco1P28271 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aco1P28271 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aco1P28271 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aco1P28271 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aco1P28271 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aco1P28271 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aco1P28271 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Aco1P28271 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aco1P28271 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Aco1P28271 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Aco1P28271 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms