Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADP27708 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADP27708 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CADP27708 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADP27708 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADP27708 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADP27708 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADP27708 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADP27708 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CADP27708 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADP27708 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADP27708 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CADP27708 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADP27708 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADP27708 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CADP27708 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CADP27708 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADP27708 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADP27708 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CADP27708 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADP27708 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADP27708 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADP27708 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADP27708 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADP27708 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CADP27708 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CADP27708 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CADP27708 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CADP27708 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CADP27708 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CADP27708 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CADP27708 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CADP27708 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CADP27708 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CADP27708 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CADP27708 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CADP27708 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CADP27708 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CADP27708 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CADP27708 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CADP27708 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CADP27708 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CADP27708 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CADP27708 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CADP27708 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CADP27708 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CADP27708 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CADP27708 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CADP27708 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CADP27708 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CADP27708 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CADP27708 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CADP27708 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CADP27708 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CADP27708 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CADP27708 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CADP27708 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CADP27708 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CADP27708 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CADP27708 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CADP27708 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CADP27708 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CADP27708 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CADP27708 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CADP27708 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CADP27708 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CADP27708 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CADP27708 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CADP27708 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CADP27708 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CADP27708 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CADP27708 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CADP27708 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CADP27708 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CADP27708 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CADP27708 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CADP27708 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CADP27708 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CADP27708 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CADP27708 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CADP27708 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CADP27708 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CADP27708 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CADP27708 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CADP27708 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms