Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CD27P26842 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD27P26842 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD27P26842 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CD27P26842 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD27P26842 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD27P26842 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD27P26842 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD27P26842 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CD27P26842 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CD27P26842 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD27P26842 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD27P26842 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD27P26842 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD27P26842 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CD27P26842 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD27P26842 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD27P26842 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CD27P26842 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD27P26842 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD27P26842 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD27P26842 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD27P26842 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CD27P26842 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD27P26842 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CD27P26842 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD27P26842 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD27P26842 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD27P26842 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CD27P26842 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD27P26842 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD27P26842 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CD27P26842 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD27P26842 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CD27P26842 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD27P26842 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD27P26842 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD27P26842 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD27P26842 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD27P26842 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD27P26842 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CD27P26842 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD27P26842 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD27P26842 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD27P26842 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD27P26842 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD27P26842 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CD27P26842 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD27P26842 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CD27P26842 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD27P26842 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD27P26842 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CD27P26842 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CD27P26842 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CD27P26842 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CD27P26842 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD27P26842 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CD27P26842 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD27P26842 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD27P26842 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD27P26842 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CD27P26842 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD27P26842 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CD27P26842 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD27P26842 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD27P26842 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CD27P26842 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD27P26842 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CD27P26842 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD27P26842 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CD27P26842 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CD27P26842 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD27P26842 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD27P26842 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD27P26842 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CD27P26842 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD27P26842 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD27P26842 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CD27P26842 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD27P26842 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CD27P26842 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD27P26842 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CD27P26842 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD27P26842 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD27P26842 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CD27P26842 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD27P26842 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD27P26842 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD27P26842 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CD27P26842 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD27P26842 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD27P26842 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD27P26842 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CD27P26842 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CD27P26842 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD27P26842 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CD27P26842 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD27P26842 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD27P26842 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CD27P26842 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms