Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
HMGB2P26583 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
HMGB2P26583 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
HMGB2P26583 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
HMGB2P26583 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
HMGB2P26583 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
HMGB2P26583 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms