Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PSMA1P25786 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMA1P25786 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PSMA1P25786 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMA1P25786 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms